Xây dựng phương pháp luận nghiên cứu hỗ trợ định danh nấm ký sinh côn trùng bằng phân tích phả hệ phân tử vùng ITS1-5.8S-ITS2

Tóm tắt

Nấm ký sinh côn trùng mà đặc biệt là Đông trùng hạ thảo (Cordyceps sinensis) là chi nấm được nhiều quốc gia, đặc biệt ở Châu Á bao gồm Việt Nam sử dụng như một vị thuốc quý trong các bài thuốc y học cổ truyền. Tuy nhiên, hiểu biết về thành phần loài của chi nấm này còn rất hạn chế bởi nhiều nguyên nhân trong đó đặc biệt phải kể đến là các khó khăn gặp phải trong công tác phân loại, định danh. Gần đây, với việc sử dụng các phương pháp dựa trên Sinh học Phân tử kết hợp với Tin- Sinh học, công việc định danh nấm phần nào được hỗ trợ tốt. Nghiên cứu bước đầu này của chúng tôi trước hết nhằm xây dựng phương pháp luận nghiên cứu, sử dụng đoạn trình tự Internal transcribed spacer – ITS làm đích, với mục tiêu hỗ trợ định danh một số mẫu nấm ký sinh côn trùng thu thập từ vùng núi Langbian, Đà lạt, Lâm đồng. Một quy trình thí nghiệm bao hàm tất cả các bước từ tách chiết DNA hệ sợi nấm, PCR , giải trình tự , hiệu chỉnh trình tự sau giải, các bước phân tích dữ liệu phân tử từ so sánh với dữ liệu Genbank hay xây dựng các cây phả hệ phân tử đều đã được thiết lập. Quy trình từ đó đã được giám định trên một tập hợp mẫu, trong đó kết quả hỗ trợ định danh bằng phương pháp vừa mới xây dựng đã cho thấy rất trùng khớp với những mẫu đã được định danh đến mức loài rõ ràng trước đó dựa trên hình thái. Phương pháp luận nghiên cứu vừa được xây dựng này vì vậy sẽ được áp dụng để hỗ trợ định danh cho bộ m u nấm ký sinh côn trùng thu thập từ vùng núi Langbian, Đà lạt, Lâm đồng, Việt Nam.