--

11 (1) 2016

Ứng dụng phương pháp PCR trong việc xác định nấm gây bệnh đạo ôn trên lúa, Magnaporthe oryzae


Tác giả - Nơi làm việc:
Đoàn Thị Hòa - Viện Nghiên Cứu Công Nghệ Sinh Học và Môi Trường, Đại học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh , Việt Nam
Võ Thị Ngọc Linh - Viện Nghiên Cứu Công Nghệ Sinh Học và Môi Trường, Đại học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh , Việt Nam
Trương Thành Nhập - Viện Nghiên Cứu Công Nghệ Sinh Học và Môi Trường, Đại học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh , Việt Nam
Nguyễn Bằng Phi - Khoa Tài Nguyên Môi Trường, Đại Học Thủ Dầu Một, Bình Dương , Việt Nam
Nguyễn Ngọc Bảo Châu - Trường Đại học Mở Thành phố Hồ Chí Minh , Việt Nam
Nguyễn Bảo Quốc - Viện Nghiên Cứu Công Nghệ Sinh Học và Môi Trường, Đại học Nông Lâm TP. Hồ Chí Minh , Việt Nam
Tác giả liên hệ, Email: Đoàn Thị Hòa - niemtincsk33@gmail.com

Tóm tắt
Nấm đạo ôn, Magnaporthe oryzae, là một trong những tác nhân gây thiệt hại rất lớn đến canh tác và sản xuất lúa trên thế giới. Triệu chứng của bệnh đạo ôn trên lúa ở giai đoạn đầu thường rất dễ bị nhầm lẫn với triệu chứng bệnh do các nấm khác gây ra, dẫn đến những khó khăn cho công tác phòng trừ bệnh kịp thời. Việc xác định nấm M.oryzae gây bệnh đạo ôn trên lúa bằng phương pháp truyền thống thường mất nhiều thời gian, công sức và đôi khi không chính xác. Một phương pháp thay thế khác bằng phản ứng chuỗi polymerase (PCR) với cặp mồi chuyên biệt Pot2 transposon nhằm giúp giảm chi phí, thời gian và công sức sẽ được thực hiện và đánh giá trong việc xác định nấm đạo ôn trong nghiên cứu này. Kết quả đã chỉ ra được tính chuyên biệt của Pot2 transposon trong việc phát hiện nấm đạo ôn và lá/cổ bông nhiễm đạo ôn trên lúa nhưng không phát hiện trên các mẫu nấm bệnh khác. Chính vì vậy phương pháp PCR được xem là phương pháp thay thế trong chẩn đoán, đặc biệt là việc phát hiện bệnh đạo ôn trên đồng ruộng.

Từ khóa
PCR; nấm đạo ôn; bào tử; Pot2 transposon; Magnaporthe oryzae

Toàn văn:
PDF

Tài liệu tham khảo

Barros TSL, Davis RE, Resende RO, Dally EL (2001). Design of a polymerase chain reaction for specific detection of corn stunt spiroplasma. Plant Disease, 85, 475-480.


Beretta MJG, Barthe GA, Ceccardi TL, Lee RF, Derrick KS (1997). A survey for strains of Xylella fastidiosa in citrus affected by citrus variegated chlorosis and cit- rus blight in Brazil. Plant Disease, 81, 1196-1198.


Chiocchetti A, Bernardo I, Daboussi MJ, Garibaldi A, Gullino ML, Langin T, Migheli Q (1999). Detection of Fusarium ox- ysporum f. sp. dianthi in carnation tissue by PCR amplification of transposon insertions. Phytopathology, 89, 1169-1175.


Errampalli D, Saunders J, Cullen D (2001). A PCR-based method for detection of potato pathogen, Helminthosporium solani, in silver scurf infected tuber tissue and soils. J Microbiol Methods, 44, 59-68.


Hà Viết Cường, Nguyễn Văn Viên, Trần Ngọc Tiệp, Hà Giang, Trần Thị Như Hoa, Nguyễn Đức Huy (2015). Đánh giá đa dạng nấm đạo ôn lúa (Pyricularia oryzae) tại đồng bằng song cửu long bằng kỹ thuật REP-PCR. Tạp chí khoa học và phát triển, 13(7), 1061-1069.


Harmon PF, Dunkle LD, Latin R (2003). A rapid PCR based method for the detection of Magnaporthe oryzae from infected perennial ryegrass. Plant Disease, 87(9), 1072-1076.


Howard RJ, Ferrari MA, Roach DH, Money NP (1991). Penetration of hard substrates by a fungus employing enormous turgor pressure. Proc Natl Acad Sci USA, 88, 11281–11284.


Kachroo P, Leong SA, Chattoo BB (1994). Pot2, an inverted repeat transposon from the rice blast fungus Magnaporthe grisea. Mol Gen Genet, 245, 339-348.


Kerkoud M, Manceau C, Paulin JP (2002). Rapid diagnosis of Pseudomonas syringae pv. papulans, the causal agent of blister spot of apple, by polymerase chain reaction using specifically designed hrpL gene primers. Phytopathology, 92, 1077-1083.


Larsen RC, Hollingsworth CR, Vandemark GJ, Gritsenko MA, Gray FA (2002). A rapid method using PCR-based SCAR markers for the detection and identifi- cation of Phoma sclerotioides: The cause of brown root rot disease of alfalfa. Plant Disease, 86, 928-932.


Nguyen QB, Kadotani N, Kasahara S, Tosa Y, Mayama S, Nakayashiki H (2008). Systemic functional analysis of calcium signaling proteins in the genome of the rice blast fungus, Magnaporthe oryzae, using a highthroughput RNA silencing system. Mol Microbiol, 68, 1348-1365.


Oliveira AC, Vallim MA (2002). Quantification of Xylella fastidiosa from cit- rus trees by real-time polymerase chain reaction assay. Phytopathology, 92, 1048-1054.


Pooler MR, Hartung JS (1995). Spe- cific PCR detection and identification of Xy- lella fastidiosa strains causing citrus varie - gated chlorosis. Curr Microbiol, 31, 377-381.


Talbot NJ (2003). On the trail of a cereal killer: Exploring the biology of Magnaporthe grisea. Annu Rev Microbiol, 57, 177–202.



Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.