Nghiên cứu các hợp chất từ Eclipta prostrata có tiềm năng ức chế enzyme RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) của virus Sars-CoV-2 bằng phương pháp Docking phân tử

Các tác giả

  • Hồ Thiên Hoàng
    Trường Đại học Công nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh, Thành phố Hồ Chí Minh, VN
  • Nguyễn Thị Uyên Thanh
    Trường Đại học Công nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh, Thành phố Hồ Chí Minh, VN
  • Quan Quốc Đăng
    Trung tâm Phát triển Khoa học và Công nghệ Trẻ, Thành phố Hồ Chí Minh Công ty Thiên Thanh Bio, Thành phố Hồ Chí Minh, VN
  • Bùi Đình Thạch
    Viện Sinh học nhiệt đới, Thành phố Hồ Chí Minh, VN

DOI:

10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.18.2.2752.2023

Từ khóa:

Covid-19; Eclipta prostrata; lắp ghép phân tử; RNA-dependent RNA polymerase (RdRp); Sars-CoV-2

Tóm tắt

Covid-19 đã và đang diễn ra do Sars-CoV-2 đã tạo ra đại dịch toàn cầu và vẫn chưa đến hồi kết thúc. Nghiên cứu này sử dụng phương pháp docking phân tử để sàng lọc các hợp chất từ Eclipta prostrata có tiềm năng bất hoạt enzyme RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) của virus Sars-CoV-2, một enzyme quan trọng trong việc sao chép của virus. Nghiên cứu này đã đánh giá một thư viện bao gồm 55 hợp chất tự nhiên từ E. prostrata chống lại protein RdRp. Trong đó, năm hợp chất tiềm năng có thể kết hợp với RdRp chủ yếu bằng các tương tác hydro giữa các hợp chất và các nhóm amino acid nằm ở vùng trung tâm hoạt động của RdRp bao gồm: echinocystis acid (T21), eclalbasaponin I (T22), ecliptasaponin A (T23), oleanolic acid (T41) và ursolic acid (T52). Sự tương tác này có tiềm năng bất hoạt enzyme RdRp, cản trở sự nhân bản của virus. Nghiên cứu này có tiềm năng mở ra cơ hội cho phát triển các thuốc chống Covid-19 từ các hợp chất tự nhiên.

Tải xuống

Dữ liệu tải xuống chưa có sẵn.

Tài liệu tham khảo

Alghamdi, H. A., Attique, S. A., Yan, W., Arooj, A., Albulym, O., Zhu, D., … Nawaz, M. Z. (2021). Repurposing the inhibitors of Covid-19 key proteins through molecular docking approach. Process Biochemistry, 110, 216-222.

Al-Kuraishy, H. M., Al-Gareeb, A. I., Negm, W. A., Alexiou, A., & Batiha, G. E.-S. (2022). Ursolic acid and Sars-CoV-2 infection: A new horizon and perspective. Inflammopharmacology, 30(5), 1493-1501.

Bibi, Z. (2008). Role of cytochrome P450 in drug interactions. Nutrition & Metabolism, 5, 1-10.

Daina, A., Michielin, O., & Zoete, V. (2017). SwissADME: A free web tool to evaluate pharmacokinetics, drug-likeness and medicinal chemistry friendliness of small molecules. Scientific Reports, 7(1), 1-13.

Feng, L., Zhai, Y.-Y., Xu, J., Yao, W.-F., Cao, Y.-D., Cheng, F.-F., … Zhang, L. (2019). A review on traditional uses, phytochemistry and pharmacology of Eclipta prostrata (L.) L. Journal of Ethnopharmacology, 245, 1-14.

Tải xuống

Các tệp bổ sung

Ngày nộp: 17-04-2023
Ngày duyệt đăng: 07-06-2023
Ngày xuất bản: 30-08-2023

Thống kê truy cập

Trang tóm tắt: 588
(English): 0
PDF: 382

Cách trích dẫn

Hoàng, H. T., Thanh, N. T. U., Đăng, Q. Q., & Thạch, B. Đình. (2023). Nghiên cứu các hợp chất từ Eclipta prostrata có tiềm năng ức chế enzyme RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) của virus Sars-CoV-2 bằng phương pháp Docking phân tử. TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ, 18(2), 13–26. https://doi.org/10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.18.2.2752.2023