Bước đầu Nghiên cứu sự Hiện diện của Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) trên Sắn (Manihot esculenta Crantz 1766)
DOI:
10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.17.2.2194.2022Từ khóa:
Begomovirus; bệnh học; sinh học phân tử virus; xét nghiệmTóm tắt
Các khảo cứu về Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) ở tải lượng virus thấp trên cây sắn (Manihot esculenta Crantz 1766), đặc biệt là giống kháng virus hoặc giống sạch bệnh thường đòi hỏi cao về hiệu suất tách chiết và phát hiện DNA mạch đơn của virus (ssDNA). Trong nghiên cứu, bốn quy trình ly trích DNA tổng sổ khác nhau được dùng nhằm mục đích tách được hàm lượng ssDNA cao. Đồng thời, sử dụng quy trình Polymerase chain reaction (PCR) và Real-time PCR (RT-PCR) để phát hiện sự hiện diện của SLCMV với các cặp mồi nhân bản gen Rep/AC1 của virus và cặp mồi nhân bản gen nội chuẩn Beta-Actin của sắn. Kết quả cho thấy, quy trình ly trích DNA cải tiến từ Mason, Caciagli, Accotto và Noris (2008) và Osena, Nyaboga và Amugune (2017), tạm gọi là R-kit, cho hàm lượng ssDNA tương đối cao tại vị trí thùy lá, được đề nghị sử dụng. Quy trình PCR và RT-PCR kiểm tra được sự hiện diện của SLCMV trên vật liệu nhiễm bệnh. Ngoài ra, quy trình RT-PCR với cặp mồi SqPCR1 và probe đặc hiệu cho phép phát hiện tín hiệu SLCMV trong mẫu lá bệnh. Hệ số nhân bản gen của cặp mồi SqPCR1 (1.851X) và Beta-Actin (1.896X) cho phép thực hiện đồng thời và phân tích kết quả cùng nhau. Ngưỡng phát hiện của RT-PCR cũng ở mức pha loãng cao hơn PCR cơ sở hỗ trợ các khảo cứu SLCMV ở tải lượng thấp trên cây mô hình và giống kháng.Tải xuống
Dữ liệu tải xuống chưa có sẵn.
Tài liệu tham khảo
Tải xuống
Ngày nộp:
28-02-2022
Ngày duyệt đăng:
14-06-2022
Ngày xuất bản:
16-09-2022
Thống kê truy cập
Trang tóm tắt: 1001 PDF: 582Cách trích dẫn
Như, T. T. H., Mai, H. T. N., Kông, L. H., Chánh, T. T., Nhạn, P. T., Khanh, L., … Hoàng, N. H. (2022). Bước đầu Nghiên cứu sự Hiện diện của Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) trên Sắn (Manihot esculenta Crantz 1766). Tạp Chí Khoa học Đại học Mở Thành phố Hồ Chí Minh - Kỹ thuật Và Công nghệ, 17(2), 5–20. https://doi.org/10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.17.2.2194.2022
Giấy phép
Bản quyền (c) 2022 Trương Thị Huỳnh Như; Huỳnh Thị Ngọc Mai; Lê Hồng Kông; Trần Trung Chánh; Phạm Thị Nhạn; Lê Khanh; Phạm Quốc An; Nguyễn Hữu Hoàng
Tác phẩm này được cấp phép theo Giấy phép quốc tế Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 .