Bước đầu Nghiên cứu sự Hiện diện của Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) trên Sắn (Manihot esculenta Crantz 1766)

Các tác giả

  • Trương Thị Huỳnh Như
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM, Việt Nam, Việt Nam
  • Huỳnh Thị Ngọc Mai
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM, Việt Nam, Việt Nam
  • Lê Hồng Kông
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM, Việt Nam, Việt Nam
  • Trần Trung Chánh
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM, Việt Nam, Việt Nam
  • Phạm Thị Nhạn
    Trung tâm Nghiên cứu Thực nghiệm Nông nghiệp Hưng Lộc, tỉnh Đồng Nai, Việt Nam
  • Lê Khanh
    Cisbay Global Inc., California, Mỹ
  • Phạm Quốc An
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM, Việt Nam, Việt Nam
  • Nguyễn Hữu Hoàng
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên - ĐHQG-HCM, Việt Nam, Việt Nam

DOI:

10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.17.2.2194.2022

Từ khóa:

Begomovirus; bệnh học; sinh học phân tử virus; xét nghiệm

Tóm tắt

Các khảo cứu về Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) ở tải lượng virus thấp trên cây sắn (Manihot esculenta Crantz 1766), đặc biệt là giống kháng virus hoặc giống sạch bệnh thường đòi hỏi cao về hiệu suất tách chiết và phát hiện DNA mạch đơn của virus (ssDNA). Trong nghiên cứu, bốn quy trình ly trích DNA tổng sổ khác nhau được dùng nhằm mục đích tách được hàm lượng ssDNA cao. Đồng thời, sử dụng quy trình Polymerase chain reaction (PCR) và Real-time PCR (RT-PCR) để phát hiện sự hiện diện của SLCMV với các cặp mồi nhân bản gen Rep/AC1 của virus và cặp mồi nhân bản gen nội chuẩn Beta-Actin của sắn. Kết quả cho thấy, quy trình ly trích DNA cải tiến từ Mason, Caciagli, Accotto và Noris (2008) và Osena, Nyaboga và Amugune (2017), tạm gọi là R-kit, cho hàm lượng ssDNA tương đối cao tại vị trí thùy lá, được đề nghị sử dụng. Quy trình PCR và RT-PCR kiểm tra được sự hiện diện của SLCMV trên vật liệu nhiễm bệnh. Ngoài ra, quy trình RT-PCR với cặp mồi SqPCR1 và probe đặc hiệu cho phép phát hiện tín hiệu SLCMV trong mẫu lá bệnh. Hệ số nhân bản gen của cặp mồi SqPCR1 (1.851X) và Beta-Actin (1.896X) cho phép thực hiện đồng thời và phân tích kết quả cùng nhau. Ngưỡng phát hiện của RT-PCR cũng ở mức pha loãng cao hơn PCR cơ sở hỗ trợ các khảo cứu SLCMV ở tải lượng thấp trên cây mô hình và giống kháng.

Tải xuống

Dữ liệu tải xuống chưa có sẵn.

Tài liệu tham khảo

Amsterdam UMC - University Medical Centers. (n.d.). Truy cập ngày 10/10/2021 tại http://LinRegPCR.nl

Cục bảo vệ thực vật. (2021). Sở NN&PTNT: Bệnh khảm lá virus lại gây hại trên cây sắn trên địa bàn tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu [Department of Agriculture and Rural Development: Virus mosaic disease again harms cassava in Ba Ria - Vung Tau Province]. Truy cập ngày 10/10/2021 tại Cổng thông tin điện tử tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu web: https://baria-vungtau.gov.vn/sphere/baria/vungtau/page/xem-tin.cpx?item=6188ec5d8ea5ccfc8db062b5 #:~:text=R%E1%BB%8Ba%20%2D%20V%C5%A9ng%20T%C3%A0u-,S%E1%BB%9F%20NN%26PTNT%3A%20B%E1%BB%87nh%20kh%E1%BA%A3m%20l%C3%A1%20virus%20l%E1%BA%A1i%20g%C3%A2y%20h%E1%BA%A1i%20tr%C3%AAn,t%E1%BB%89nh%20B%C3%A0%20R%E1%BB%8Ba%20%2D%20V%C5%A9ng%20T%C3%A0u&text=B%E1%BB%87nh%20kh%E1%BA%A3m%20l%C3%A1%20virus%20h%E1%BA%A1i,thu%E1%BB%99c%20chi%20Begomovirus%20g%C3%A2y%20ra

Dixon, A. G. O., Ogbe, F. O., & Okechukwu, R. U. (2010). Cassava mosaic disease in Sub-Saharan Africa: A feasible solution for an unsolved problem. Outlook on Agriculture, 39(2), 89-94. doi:10.5367/000000010791745349

El-Sharkawy, M. A., de Tafur, M. M. S., & Cadavid, L. L. F. (1993). Photosynthesis of cassava and its relation to crop productivity. In W. M. Roca & A. M. Thro (Eds.), International scientific meeting cassava biotechnology network (pp. 314-324). Cali, CO: Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT).

Hanley-Bowdoin, L., Bejarano, E. R., Robertson, D., & Mansoor, S. (2013). Geminiviruses: Masters at redirecting and reprogramming plant processes. Nature Reviews Microbiology, 11(11), 777-788. doi:10.1038/nrmicro3117

Tải xuống

Ngày nộp: 28-02-2022
Ngày duyệt đăng: 14-06-2022
Ngày xuất bản: 16-09-2022

Thống kê truy cập

Trang tóm tắt: 1001
PDF: 582

Cách trích dẫn

Như, T. T. H., Mai, H. T. N., Kông, L. H., Chánh, T. T., Nhạn, P. T., Khanh, L., … Hoàng, N. H. (2022). Bước đầu Nghiên cứu sự Hiện diện của Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) trên Sắn (Manihot esculenta Crantz 1766). Tạp Chí Khoa học Đại học Mở Thành phố Hồ Chí Minh - Kỹ thuật Và Công nghệ, 17(2), 5–20. https://doi.org/10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.17.2.2194.2022

Các bài báo tương tự

Bạn cũng có thể bắt đầu một tìm kiếm tương tự nâng cao cho bài báo này.