Tối ưu hóa phản ứng realtime PCR nhằm phát hiện Streptococcus agalactiae

Các tác giả

  • Nguyễn Thị Thanh Thảo
    Trường Đại học Mở Thành phố Hồ Chí Minh, VN
  • Nguyễn Thị Trúc Phương
    Công ty cổ phần Công nghệ TBR, TP. Hồ Chí Minh, VN
  • Nguyễn Thị Trúc Anh
    Công ty cổ phần Trung tâm xét nghiệm chẩn đoán Y Khoa Hanhphuclab, VN
  • Lương Thị Mỹ Ngân
    Trường Đại học Khoa học Tự nhiên – ĐHQG TP.HCM, VN

DOI:

10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.16.1.1867.2021

Từ khóa:

cfb; nhiễm trùng sơ sinh; realtime PCR; Streptococcus agalactiae

Tóm tắt

Streptococcus agalactiae (GBS) là tác nhân truyền nhiễm hàng đầu gây nhiễm trùng huyết sơ sinh giai đoạn sớm. Tầm soát GBS và tiêm kháng sinh dự phòng ở phụ nữ thai sản có thể giúp ngăn chặn hữu hiệu tỷ lệ nhiễm GBS ở trẻ sơ sinh. Phương pháp truyền thống phát hiện và nuôi cấy GBS trên đĩa thạch máu rất tốn thời gian, công sức và độ nhạy thấp. Nghiên cứu này tiến hành tối ưu hóa phản ứng realtime PCR với cặp mồi và mẫu dò được thiết kế nhằm phát hiện gen đặc hiệu cfb của GBS. Các thí nghiệm tối ưu hóa được thực hiện trên chủng S. agalactiae ATCC 13813. Độ đặc hiệu của quy trình tối ưu được kiểm tra trên DNA của chủng Staphylococcus aureus ATCC 25923, Gardnerella vaginalis và Chlamydia trachomatis. Ngoài ra, quy trình tối ưu được thử nghiệm trên 30 mẫu dịch phết âm đạo-trực tràng của phụ nữ mang thai trong giai đoạn 35-37 tuần. Quy trình tối ưu đặc hiệu với chủng GBS, có độ nhạy 50 bản sao/phản ứng, độ chính xác 99.94%, và hiệu quả khuếch đại EA% = 94.5%. Trong số 30 mẫu thử nghiệm, 10 mẫu được phát hiện là có hiện diện của GBS, trong khi nuôi cấy truyền thống chỉ phát hiện 08 mẫu có GBS.

Tải xuống

Dữ liệu tải xuống chưa có sẵn.

Tài liệu tham khảo

Carbone, F., Montecucco, F., & Sahebkar, A. (2020). Current and emerging treatments for neonatal sepsis. Expert Opinion on Pharmacotherapy, 21 (5), 549-556.

Carrillo-Ávila, J., Gutiérrez-Fernández, J., González-Espín, A., García-Triviño, E., & Giménez-Lirola, L. (2018). Comparison of qPCR and culture methods for group B Streptococcus colonization detection in pregnant women: Evaluation of a new qPCR assay. BMC Infectious Diseases, 18 (1), 1-8.

Deer, D., Lampel, K., & González‐Escalona, N. (2010). A versatile internal control for use as DNA in real‐time PCR and as RNA in real‐time reverse transcription PCR assays. Letters in Applied Microbiology, 50 (4), 366-372.

Fairlie, T., Zell, E. R., & Schrag, S. (2013). Effectiveness of intrapartum antibiotic prophylaxis for prevention of early-onset group B streptococcal disease. Obstetrics & Gynecology, 121 (3), 570-577.

IDT. (n.d.). Retrieved March 10, 2021, from https://www.idtdna.com/pages/tools/oligoanalyzer

Tải xuống

Ngày nộp: 29-04-2021
Ngày duyệt đăng: 25-05-2021
Ngày xuất bản: 07-07-2021

Thống kê truy cập

Trang tóm tắt: 1046
PDF: 1209

Cách trích dẫn

Thảo, N. T. T., Phương, N. T. T., Anh, N. T. T., & Ngân, L. T. M. (2021). Tối ưu hóa phản ứng realtime PCR nhằm phát hiện Streptococcus agalactiae. TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ, 16(1), 34–46. https://doi.org/10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.16.1.1867.2021